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當前位置:首頁技術文章Parse Biosciences:告別微流控,用‘固定樣本’重新定義單細胞測序

Parse Biosciences:告別微流控,用‘固定樣本’重新定義單細胞測序

更新時間:2025-06-04點擊次數:1008

Parse Biosciences:告別微流控,用‘固定樣本’重新定義單細胞測序

Parse Biosciences是一家專注于單細胞測序技術研發與應用的生物科技公司,致力于通過創新技術降低科研門檻并推動生命科學研究的邊界。公司核心優勢在于的組合條形碼(combinatorial barcoding)技術,該技術無需依賴復雜儀器即可實現大規模單細胞實驗,最高可同時處理500萬細胞及384個樣本的實驗需求(如旗艦產品Evercode WT Penta)。這一突破使研究人員能夠以傳統液滴法無法企及的通量和成本效益開展深度研究。

Parse的產品矩陣覆蓋從基礎轉錄組到免疫分析的全場景需求。其全轉錄組系列(WT Mini/Mega/Penta)提供靈活的通量選擇,結合專有的樣本固定技術,允許用戶根據實驗節奏安排樣本處理,減少實驗誤差。免疫分析產品線(TCR/BCR)則聚焦于免疫系統的復雜性,通過單細胞分辨率解析T/B細胞受體與基因表達的關聯,助力腫瘤免疫治療等領域的突破。此外,CRISPR Detect和Gene Select模塊分別針對基因編輯篩選和靶向測序優化,擴展了技術的應用維度。

技術優勢體現在三大層面:其一,高通量低偏差,組合條形碼有效規避液滴法中的擴增偏差與背景噪音,顯著提升低豐度基因檢出率;其二,全流程自動化,從樣本固定到數據分析的端到端解決方案(含Trailmaker生物信息學平臺)降低操作門檻;其三,靈活適配性,兼容新鮮/凍存樣本及多種組織類型,滿足基礎研究與臨床轉化的雙重需求。第三方驗證數據顯示,其在小鼠腦組織、PBMC等樣本中展現出優于主流液滴技術的細胞捕獲效率與基因檢測深度。

作為一家技術驅動型公司,Parse已建立全球合作伙伴網絡,服務超2000家實驗室,客戶涵蓋頂尖高校、藥企及CRO機構。其學術合作成果頻現于《Nature》《Cell》子刊,近期研究包括免疫系統發育圖譜繪制與癌癥微環境動態解析。公司持續推動技術迭代,計劃將單細胞多組學整合至現有平臺,并拓展空間轉錄組應用場景。


核心優勢

1.革命性Evercode技術

無需微流控設備:突破傳統液滴法限制,支持標準實驗室操作,大幅降低硬件依賴。

超高通量:單次實驗可分析1萬至500萬個細胞,滿足大規模研究需求(如2025年推出的Evercode WT Penta試劑盒)。

樣本靈活性:支持細胞/核固定技術,樣本可穩定保存6個月,便于時間序列研究或跨實驗整合。

2.數據質量與靈敏度

通過組合條碼系統(Evercode Barcoding)實現高特異性,檢測靈敏度優于傳統方法,減少測序深度需求。

集成數據分析工具Trailmaker™,提供從原始數據到可視化報告的全流程支持,無需編程基礎。

3.多組學擴展能力

產品線涵蓋轉錄組、TCR/BCR免疫組庫、CRISPR篩選及染色質可及性分析,支持跨維度研究。


主要產品、技術介紹:

1.EVERCODE™ WT MINI

Parse Biosciences:告別微流控,用‘固定樣本’重新定義單細胞測序

Evercode™ WT Mini 的尺寸非常適合開始探索單細胞轉錄組學,并體驗 Parse 能帶來的高質量結果。在擴展到 Evercode™ WT 或 Evercode™ WT Mega 之前,先生成概念驗證結果,深入研究你的生物學。

Evercode™ 分池組合條形碼是一種簡單、無需儀器的單細胞測序解決方案。這種易于采用的方法為任何實驗室帶來了高的靈敏度、可擴展性和靈活性。


2.EVERCODE™ WT

Parse Biosciences:告別微流控,用‘固定樣本’重新定義單細胞測序

Parse Biosciences Evercode™ WT 組合條形碼技術與基于液滴的10x Genomics™ Chromium™ Next GEM單細胞3’試劑盒v3.1(帶有小鼠大腦核)進行了比較。這種異質樣本類型一直是細胞圖譜項目的重點,也是個別研究人員的關注點。

收集了兩個E18期的C57/BI6胚胎樣本,沿著矢狀方向切分為兩半,并由第三方組織供應商快速冷凍。每只大腦的一半被運送到10x Genomics™認證的服務提供商,他們使用Chromium™ Nuclei Isolation Kit分離細胞核,并使用Chromium™ Next GEM Single Cell 3’ GEM Library & Gel Bead Kit v3.1建立測序文庫。每只大腦的另一半由Parse Biosciences處理,使用dounce勻漿器分離細胞核,用Evercode™ Nuclei Fixation v2固定,并用Evercode™ WT v2進行文庫制備。每種技術的測序文庫由第三方進行測序。測序數據使用各制造商的數據分析管道進行分析。


3.EVERCODE™ BCR

Parse Biosciences:告別微流控,用‘固定樣本’重新定義單細胞測序

探索具有EverCode™BCR的各種自適應免疫應用 - 不含儀器的固定樣品BCR分析解決方案,可檢測全長,本機的重型和輕型鏈序列,以全面地表征BCR庫。

捕獲全長B細胞受體序列與基因表達——以龐大的規模實現同步解析

通過靈敏檢測B細胞受體,揭示免疫組庫的全部復雜性。在同一細胞中測定全轉錄組基因表達,并獲取配對的重鏈/輕鏈全長序列及其同種型信息。


目標客戶群體

科研機構:高校、醫學研究中心,需開展癌癥、神經退行性疾病等單細胞機制研究。

制藥與生物技術公司:用于靶點發現、藥物篩選及臨床試驗生物標志物開發。

臨床診斷實驗室:推動個性化醫療,如腫瘤微環境分析、免疫治療響應預測。


常見問題與解答

Q1:Evercode技術是否兼容現有測序平臺?

A:是的!Parse試劑盒生成的標準FASTQ文件可兼容Illumina、NovaSeq等主流平臺,且數據分析工具支持與10x Genomics、BD Rhapsody數據混合分析。

Q2:樣本處理需要特殊設備嗎?

A:無需微流控儀器。Evercode固定技術僅需常規移液設備,樣本可常溫運輸。

Q3:如何解決低起始量樣本的挑戰?

A:推薦使用Evercode Low Input Fixation Kit,支持100個細胞起始,保留表觀遺傳信息。

Q4:單次實驗成本是否過高?

A:Evercode技術通過超高通量降低單細胞成本。例如,Evercode WT Penta試劑盒可分析500萬個細胞,性價比顯著優于同類產品。

Q5:是否提供定制化服務?

A:是的!Parse提供從實驗設計到數據分析的全流程支持,包括基因組定制文庫構建和AI驅動的大規模篩選服務。


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